Cụ thể, đối với dự án Khu tái định cư An Phú Tây của Công ty CP phát triển Nam Sài Gòn, TP kiến nghị không thu 27,7 tỷ đồng tiền sử dụng đất vì UBND TP thu hồi lại diện tích đất tăng thêm để thực hiện chương trình 11.000 căn hộ tái định cư.
Khu tái định cư và công trình công cộng – khu số 11 của Công ty CP đầu tư xây dựng Bình Chánh, TP kiến nghị không thu 140 tỷ đồng. Do điều chỉnh lại quy hoạch. Trước đây, TP tạm giao cho công ty khu dân cư 11A có tổng diện tích là 552.798 m2, tiền sử dụng đất phải nộp là 170 tỷ đồng, công ty đã nộp 30 tỷ đồng.
Sau đó, TP đã thu hồi đất giao 4 đơn vị khác nhau, gồm: 20.453 m2 cho Trường trung cấp xây dựng; thu hồi 55.204 m2 cho Trường đại học tư thục Kinh tế; 103,871 m2 cho Công ty TNHH BSC -WCT giải phóng mặt bằng, làm chủ đầu tư. Đối với diện tích còn lại là 175.043m2, UBND TP tiếp tục giao cho Công ty xây dựng Bình Chánh thực hiện dự án, hiện công ty đang làm thủ tục để được giao đất chính thức, thủ tục đầu tư để có cơ sở pháp lý thực hiện dự án.
Dự án Khu định cư Phong Phú 4 của Công ty CP đầu tư xây dựng Bình Chánh, TP kiến nghị không thu tiền sử dụng đất vì đây là diện tích đất tăng thêm (7.037 m2) do điều chỉnh diện tích đất ở được giao.
Dự án khu nhà ở Phước Long B của Công ty TNHH xây dựng và kinh doanh nhà Gia Hoà, TP kiến nghị không thu 3,6 tỷ. Lý do, Cơ quan Thuế áp dụng giá đất năm 2004 để tính tiền, Thanh tra yêu cầu áp dụng giá đất 2009. Qua ra soát dự án được giao đất năm 2004, nên việc cơ quan thuế của TPHCM áp dụng giá đất năm 2004 là đúng quy định.
Dự án khu nhà ở kinh doanh Phước Long B của Công ty xây dựng và dịch vụ An Thiên Lý, TP kiến nghị không thu 1,7 tỷ đồng. Qua kiểm tra, do Đoàn thanh tra tính trùng, diện tích đất tăng thêm này công ty đã nộp tiền sử dụng đất trong tổng số tiền sử dụng đất phải nộp.
Khu 6B – lô số 7 của Công ty CP đầu tư kinh doanh nhà Intresco, TP kiến nghị không thu 11,6 tỷ đồng. Nguyên nhân giảm là do tính lại tiền sử dụng đất theo diện tích thực tế tại thời điểm bồi thường, giải phóng mặt bằng.
Dự án khu nhà ở phường Bình Trưng Đông – Cát Lái của Công ty TNHH MTV xây dựng và kinh doanh nhà Phú Nhuận, không thu tiền sử dụng đất vì năm 2014 UBND TP đã thu hồi, huỷ bỏ dự án do chậm tiến độ, chưa hoàn tất công tác giải phóng mặt bằng.
Đối với phần diện tích 8.800m2 để xây dựng trạm xăng dầu thuộc dự án Khu dân cư ấp 4 xã Tân Tạo, huyện Bình Chánh nay là quận Bình Tân, UBND TP kiến nghị điều chỉnh giảm 528 triệu đồng vì Công ty đã nộp số tiền này vào ngân sách nhà nước và hoàn tất thủ tục thuê đất.
Dự án đầu tư xây dựng nhà ở tại xã Phong Phú, huyện Bình Chánh của Công ty CP đầu tư phát triển Phú Mỹ, TP kiến nghị không thu 14,2 tỷ đồng.
Trước đó, Thanh tra Chính Phủ cũng nhận định UBND TP đề nghị không thu số tiền 708 tỷ đồng của 10 dự án trên là có cơ sở. Do đó, căn cứ vào quy định của pháp luật về thu tiền sử dụng đất tại các thời kỳ, Tổ công tác liên ngành và Thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng Chính phủ điều chỉnh giảm số tiền sử dụng đất phải nộp của các dự án nêu trên.
